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Software zur Unterstützung von DNA-Sequenzvergleichen und Befundung

Projektdauer: 5 Monate

Kurzbeschreibung

Analyse, Fachkonzeption und Erstellung einer Software für die Verwaltung von DNA-Sequenzen der HIV-Virusstämme aus Isolaten einzelner AIDS-Patienten.

Ergänzung

Potenziell mutierte DNA-Virus-Sequenzen werden durch einen Internet-Dienst nach unterschiedlichen Algorithmen mit einer Referenzsequenz verglichen. Die Ergebnisse solcher Vergleiche werden von der Software importiert, verwaltet und historisiert. Resultate der Untersuchungen werden aufbereitet und auf einem patientenbezogenen Befund für den behandelnden Arzt gedruckt.

Fachbeschreibung

HIV-Virusstämme mutieren sehr schnell und entwickeln deshalb auch sehr schnell Resistenzen gegen die eingesetzten Medikamente. Um trotzdem eine Therapie zu ermöglichen, wird im Fall einzelner Patienten die Erbinformation durch DNA-Sequenzierung untersucht. Damit können Mutationen des untersuchten Virusstammes im Vergleich mit den DNA-Sequenzen anderer Virusstämme aus DNA-Sequenzdatenbanken genau identifiziert werden. Die bei dem Sequenzvergleich ermittelten Informationen erlauben Rückschlüsse auf die Resistenz bzw. Empfindlichkeit des untersuchten Virusstammes für bestimmte AIDS-Medikamente und erlauben damit eine spezifische Auswahl von Medikamenten für die Behandlung des Patienten.

Überblick

Projektzeitraum13.10.2003 - 16.03.2004

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